1.海洋保育類野生動物登(註)記管理
2.涉違反野生動物保育法之海洋野生動物贓證物代存管理
3.涉違反野生動物保育法之海洋野生動物相關沒入工作
4.海洋野生動物鑑識憑證核發或協助相關機關辦理鑑定
5.海洋保育類野生動物之收容、野放或取締工作
6.違反野生動物保育法海洋野生動物相關行政罰裁罰
7.沙氏變色蜥移除相關業務與其他外來入侵種動物相關業務
8.學術或教育目的利用野生動物審查及利用保育類野生動物初審
9.保育團體申請自然保育活動經費補助管理
10.執行林務局生物多樣性與入侵種管理計畫、瀕危物種及重棲地生態服務給付推動方案
11.執行海洋保育署海洋野生動物及生態保育計畫及海洋保育教育推廣計畫
12.鯨豚、海龜擱淺救援、後送與收容
13.上級交辦業務
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